СТРУКТУРА ГЕНОТИПОВ МИКОБАКТЕРИЙ ТУБЕРКУЛЕЗА В ОМСКОЙ ОБЛАСТИ - РЕГИОНЕ ПРИГРАНИЧНЫМ С КАЗАХСТАНОМ
Main Article Content
Authors
А.А. Вязовая
ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера,Российская Федерация, 197101, Санкт-Петербург, ул. Мира д.14
И.В. Костюкова
Клинический противотуберкулезный диспансер, Российская Федерация, Омск
Д.Р. Терентьева
ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера,Российская Федерация, 197101, Санкт-Петербург, ул. Мира д.14
Д.А. Найзабаева
Филиал ТОО «Национальный центр биотехнологии», Республика Казахстан, Алматы
Казахский Национальный Университет имени Аль-Фараби, Республика Казахстан, Алматы
Э.Р. Мальцева
Филиал ТОО «Национальный центр биотехнологии», Республика Казахстан, Алматы
О.А. Пасечник
Омский государственный медицинский университет, Российская Федерация, Омск
Ю.А. Скиба
Филиал ТОО «Национальный центр биотехнологии», Республика Казахстан, Алматы
И.В. Мокроусов
ФБУН НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Пастера,Российская Федерация, 197101, Санкт-Петербург, ул. Мира д.14
Abstract
На территории Омской области с 2009 по 2021 г. отмечено существенное снижение заболеваемости туберкулезом (ТБ) – с 130,7 до 48,4 случая на 100 тыс. населения. Однако возросла с 15,5% до 30,6% доля впервые выявленных бактериовыделителей штаммов Mycobacterium tuberculosis с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ). Омская область на юге граничит с Казахстаном, где доля первичной МЛУ-ТБ в 2021 году составила 34%, а в популяции возбудителя ТБ превалирует генотип Beijing (89,7%), в частности штаммы кластера Central Asian/Russian. Целью работы являлся молекулярно-генетический мониторинг популяции возбудителя ТБ в Омской области.
Материалы и методы. Изучено 219 штаммов M. tuberculosis от впервые выявленных больных туберкулезом легких в Омской области (2021-2022 гг.). Принадлежность к генотипу Beijing и его основным субтипам определяли разработанными нами методами на основе ПЦР. Штаммы других генотипов были сполиготипированы, с последующим сравнением с международной базой данных SITVIT2. Также генотипировали 39 образцов ДНК M. tuberculosis из Акмолинской области Казахстана (2008 г.).
Установлена принадлежность 65,8% (144/219) российских штаммов M. tuberculosis к генетическому семейству Beijing, при этом 50,7% (73/144) из них обладали МЛУ. Штаммы Beijing были представлены двумя основными субтипами: B0/W148 - 27,8% (40) и Central Asian/Russian – 61,8% (89). Доли МЛУ-штаммов Beijing кластеров B0/W148 и Central Asian/Russian существенно различались: 80,0% (32/40) и 32,9% (29/89) соответственно (p<0,0001). В структуре Central Asian/Russian выявлено 9 (4,1% во всей коллекции) штаммов субтипа Central Asian Outbreak (CAO). Восемь из 9 штаммов САО были МЛУ, что было значимо выше, чем доля МЛУ среди остальных штаммов Central Asian/Russian (26,3%, 21/80; p=0,0043). В российской коллекции штаммы других генетических семейств - LAM, Ural, T, Haarlem составили 34,2% (75/219), из них 26,7% (20) обладали МЛУ. Сравнение с данными по Омской области за 2015-2017 гг. не выявило значимых различий Анализ ДНК M. tuberculosis из Казахстана, показал доминирование генотипа Beijing Central Asian Outbreak (79,5%, 31/39), в частности субтипа CAO (64,1%, 25/39). Все штаммы САО были лекарственно-устойчивыми, а 60,0% (15/25) характеризовались МЛУ.
В современной популяции M. tuberculosis в Омской области преобладают штаммы генотипа Beijing субтипов Central Asian/Russian и B0/W148. Несмотря на доминирование штаммов субтипа CAO в Северном Казахстане (64%), его доля в приграничной Омской области остается незначительной (4%). Штаммы генотипа Beijing B0/W148 продолжают играть ключевую роль в распространении МЛУ-ТБ в Омской области, как и в России в целом.
Исследование выполнено при финансовой поддержке гранта РНФ 24-44-00004.