РАЗРАБОТКА ПЦР ТЕСТ-СИСТЕМЫ ДЛЯ ОДНОВРЕМЕННОЙ ДИАГНОСТИКИ ГРИППА И РИНОПНЕВМОНИИ ЛОШАДЕЙ
Main Article Content
Authors
К.О. Карамендин
РГП «Институт микробиологии и вирусологии», г. Алматы
А.И. Кыдырманов
РГП «Институт микробиологии и вирусологии», г. Алматы
М.Х. Саятов
РГП «Институт микробиологии и вирусологии», г. Алматы
Abstract
В статье представлены результаты экспериментальных работ по секвенированию М гена вируса гриппа лошадей, выбору консервативного участка gB гена вируса ринопневмонии лошадей, конструированию и подбору специфических праймеров. Приводятся данные по оптимизации параметров ПЦР для дифференциальной диагностики возбудителей этих широко распространенных инфекций.
Секвенированы M и gB гены вирусов гриппа и ринопневмонии лошадей, проведено выравнивание с полными нуклеотидными последовательностями из международных баз данных. Выбраны наиболее консервативные участки геномов для дальнейшей разработки праймеров.
Сконструированы сегментспецифические праймеры для постановки мультиплекс ПЦР с целью одновременной диагностики гриппа и ринопневмонии лошадей.
После тестирования при одинаковых условиях ПЦР отобраны наиболее оптимальные праймеры, работающие при одних и тех же параметрах термоциклирования.
Установлен оптимальный режим совместимости праймеров с отработкой температурно-временных показателей для постановки мультиплекс - ПЦР.
Keywords
грипп лошадей, ринопневмония, дуплекс ПЦР, праймер
Article Details
References
. Сюрин В.Н., Самуйленко А.Я., Соловьев Б.В., Фомина Н.В. Парамиксовирусные инфекции // Вирусные болезни животных. – 1998. – М.: ВНИТИБП. – С. 214-233.
. Кыдырманов А.И., Кумекбаева Ж., Карамендин К.О. и др. Изоляция вируса гриппа а (H3N8) от лошадей в Казахстане в 2007 г. // НПЖ Ветеринария. – 2009. - №1 (5). - С. 52-54.
. OIE Terrestrial Manual. Chapter 2.5.9. Equine rhinopneumonitis. – 2008. – P. 894-903.
. WHO Manual on Animal Influenza Diagnosis and Surveillance.WHO/20-02.5. - 2003. – P. 3-4.
. Hoffmann E., Stech J., Guan Y. Universal primer set for the full-length amplification of all influenza A viruses// Arch Virol. - 2001. - Vol. 146. – P. 2275-2289.
. Altschul S.F., Gish W., Miller W., Myers E.W., Lipman D.J., Basic local alignment search tool, JMol Biol. - №215. – 1990. - P. 403–410.