1/2017
Sikhayeva N.S.1,2,Dzharmukhanov Zh.M.1, Nakysh A.T.3, Smagulova S.K.4, Shaimerdenov S.A.4, Baidurin S.A.3, Zholdybayeva E.V.1, Ramankulov E.M.1,2
1National center for biotechnology, 
Korgaldzyn av., 13/5, Astana, 010000, Kazakhstan
2L.N. Gumilyov Eurasian National University, 
Munaitpasova str., 5, Astana, 010000, Kazakhstan
3Astana Medical University, 
Koshkarbayeva str., 66, Astana, 010000, Kazakhstan
4City polyclinic №4,
Shevchenko str., 4, Astana, 010000, Kazakhstan
This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

ABSTRACT

Diabetes and obesity are multifactorial diseases that are major global health problems. The pathogenic mechanisms of these diseases include several pathways operating under the influence of the interaction of genetic and environmental factors. According to numerous studies, there are multiple loci that contribute to the risk of multifactorial (polygenic) diseases. It was previously demonstrated that polymorphisms in the GCK, YKT6and INSIG2 genes are associated with the risk of type 2 diabetes and obesity in different populations. This study aimed to investigate the association of GCK, YKT6 and INSIG2 allelic polymorphisms and risk of type 2 diabetes and obesity in a Kazakh population. The study included patients diagnosed with type 2 diabetes. The control group consisted of healthy volunteers who were invited to participate in the study during a routine health examination. A total of 662 participants of Kazakh nationality were genotyped for two single nucleotide polymorphisms: rs4607517 and rs7566605. The results of genetic analysis revealed a statistically significant association between polymorphisms inGCK, YKT6 and INSIG2 and risk of type 2 diabetes (rs4607517: OR = 0.70, CI = 0.51–0.95, p = 0.024 in the additive model) and obesity (rs4607517: OR = 0.20, CI = 0.03–0.82, p = 0.045; rs7566605: OR = 1.82, CI = 1.11–3.02, p = 0.018 in the recessive model). In addition, these polymorphisms were associated with different blood parameters, including hemoglobin, erythrocytes, and mean platelet volume. In conclusion, we observed a statistically significant association between GCK, YKT6 and INSIG2 polymorphisms and risk of developing type 2 diabetes and obesity in a Kazakh population.
Keywords : Single nucleotide polymorphism, type 2 diabetes, obesity, Kazakh population

УДК 61:575

АССОЦИАЦИЯ ПОЛИМОРФИЗМОВ RS4607517 ИRS7566605 С РИСКОМ РАЗВИТИЯ ДИАБЕТА 2 ТИПА И ОЖИРЕНИЯ В КАЗАХСКОЙ ПОПУЛЯЦИИ

Сихаева Н.С.1,2, Джармуханов Ж.М.1, Накыш А.Т.3, Смагулова С.К.4, ШаймерденовС.А.4, БайдуринС.А.3, ЖолдыбаеваЕ.В.1, РаманкуловЕ.М.1,2
1РГП на ПХВ «Национальный центр биотехнологии»,
КН МОН РК, Кургальжинское шоссе, 13/5, Астана, 010000, Казахстан
2РГП на ПХВ «Евразийский национальный университет им. Л.Н. Гумилева»,
ул. Мунайтпасова, 5, Астана, 010000, Казахстан
3АО «Медицинский университет Астана»,
пр. Кошкарбаева, 66, Астана, 010000, Казахстан
4ГКП на ПХВ «Городская поликлиника №4», 
ул. Т.Шевченко, 4, Астана, 010000, Казахстан
This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

 

АБСТРАКТ

Сахарный диабет и ожирение – мультифакториальныезаболевания, которые являются основными проблемами глобального здравоохранения 21-го века. Патогенные механизмы развития этих заболеваний, включают в себя несколько путей, которые находятся под влиянием взаимодействующих генетических и экологических факторов. Согласно многочисленным исследованиям, существуют множественные локусы, которые вносят вклад в риск развития мультифакториальных (полигенных) заболеваний. Так ранее была продемонстрирована ассоциация полиморфизмов в генахGCK-YKT6 и INSIG2 с риском развития сахарного диабета 2 типа и ожирения в различных популяциях. Целью данной работы является исследование ассоциации аллельного полиморфизма генов GCK-YKT6 и INSIG2 с риском развития сахарного диабета 2 типа и ожирения в казахской популяции.В исследование включены пациенты с диагнозом сахарный диабет 2 типа. Контрольную группу составили практически здоровые люди, приглашенные в исследование из поликлиник при обращении на обследование.662 участника исследования казахской национальности были генотипированы по двум однонуклеотидным полиморфизмам: rs4607517 и rs7566605.Результаты генетического анализа выявили статистически достоверные ассоциации междуполиморфизмамигеновGCK-YKT6 иINSIG2c риском развития сахарного диабета 2 типа (rs4607517:OR=0.70, CI=0.51-0.95, p=0.024 в аддитивной модели) и ожирения (rs4607517: OR=0.20, CI=0.03-0.82, p=0.045; rs7566605: OR=1.82, CI=1.11-3.02, p=0.018 в рецессивной модели). Исследуемые полиморфизмы также были ассоциированы с различными уровнями показателей крови: гемоглобин, эритроциты и средний объем тромбоцитов. В заключении, мы обнаружили статистически достоверные ассоциации междуполиморфизмамигеновGCK-YKT6 иINSIG2 c риском развития СД2 и ожирения в казахской популяции.

Ключевые слова: однонуклеотидныйполиморморфизм, сахарный диабет 2 типа, ожирение, казахская популяция. 


ВВЕДЕНИЕ

Сахарный диабет и ожирение –мультифакториальныезаболевания, которые являются основными проблемами глобального здравоохранения 21-го века. Согласно Американской диабетической ассоциации (АДА), диабет – это группа метаболических нарушений, характеризующийся гипергликемией, которая является результатом дефектов секреции инсулина, действия инсулина или сочетание обоих этих факторов [1]. Согласно данным МеждународнойФедерации Диабета (МФД), в 2015 году количество человек страдающих диабетом превысило 415 миллионов человек в мире. МДФ предсказывает, что если нынешние темпы роста продолжатся, к 2040 году ожидается увеличение распространенности диабета до 642 миллионов человек [2].
В отличие от сахарного диабета 1 типа, который является иммуноопосредованным, идиопатическим заболеванием, сахарный диабет 2 типа (СД2) характеризуется преимущественной инсулинорезистентностью (ИР) (снижена чувствительность рецепторов инсулинзависимых тканей к инсулину) и относительной инсулиновой недостаточностью или преимущественным нарушением секреции инсулина с ИР или без нее [1].СД2 является наиболее распространенной формой диабета и его распространенность увеличилась наряду с культурными и социальными изменениями.
Ожирение – это хроническое заболевание обмена веществ, которое проявляется избыточным развитием жировой ткани, прогрессирует при естественном течении и характеризуется высокой вероятностью рецидива после окончания курса терапии. Ожирение занимает одно из ведущих мест и является болезнью цивилизации из-за условий, которые создаются благодаря развитию общества: рафинированное питание с большим содержанием жиров и углеводов с высоким гликемическим индексом, гиподинамия, переедание и нарушение режима дня [3].
Обширные генетические исследования мультифакториальных заболеваний подтвердили, что несколько генетических вариаций способствуют риску заболевания и для которых каждая генетическая вариация имеет влияние на уровень риска. ГенGCK кодирует фермент глюкокиназу, который регулирует метаболизм глюкозы в некоторых тканях, включая печень и поджелудочную железу. Полиморфизм этого гена rs4607517 ассоциирован с уровнями глюкозы натощак и СД2 в разных популяциях [4]. Ген INSIG2 кодирует мембранный белок эндоплазматического ретикулума, участвующий в регуляции синтеза холестерола, ненасыщенных жирных кислот, фосфолипидов и триглицеридов, а также в гомеостазе глюкозы [5]. Согласно исследованиям, полиморфизм этого гена rs7566605 ассоциирован с ожирениемигиперхолестеринемией [6]. 
Целью данной работы является исследование ассоциации аллельного полиморфизма генов GCK и INSIG2 с риском развития СД2 и ожирения в казахской популяции. 

 

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

Объекты исследования

В исследование включены пациенты (казахской национальности) с диагнозом СД2. Диагноз СД2 был поставлен согласно критериям диагностики Всемирной Организации Здравоохранения (ВОЗ) (уровень глюкозы натощак ≥7.0 ммоль/л и/или тест на HbA1c ≥6.5%, и/или постпрандиальный тест на глюкозу ≥11.1 ммоль/л)[7, 8]. Контрольную группу составили практически здоровые люди, приглашенные в исследование из поликлиник при обращении на обследование. Участники, которые имели острые хронические заболевания, а также беременные были исключены из исследования. 
Ожирение было определено в соответствии с критериями ВОЗ: нормальный вес: 18,5 кг/м2 ≤ИМТ<25 кг/м2; и ожирение: ИМТ≥30 кг/м2. Всем участникам объяснялись цель и задачи планируемого исследования. После получения информированного согласия на участие в исследовании всем участникам проводили интервью по специальным анкетам-опросникам. У всех участников исследования производился забор образцов биологического материала (кровь). Объектом исследования являлась ДНК, выделенная из венозной крови участников исследования.Протокол исследования был одобрен этическим комитетом Национального центра биотехнологии (№10.14.03.2012).

Выделение ДНК из крови

ДНК из крови выделяли согласно классическому методу высаливания [9]. Количественное содержание ДНК оценивали на спектрофотометре (Nanodrop 1000). 

Клиническое обследование

Обследование пациентов включало в себя анализ жалоб, сбор анамнеза, физикальный осмотр и оценку антропометрических показателей – определяли рост, массу тела, рассчитывали индекс массы тела (ИМТ). Также проводилось измерение артериального давления (АД).

Определение биохимических показателей

Стандартные биохимические исследования для группы больных и группы контроля были проведены в лаборатории клинической базы Казахского национального университета имени С.Д. Асфендиярова.

Генотипирование полиморфизмов

Генотипирование полиморфизмов (таблица 1) проводили с помощью ПЦР в режиме реального времени

 

Таблица 1. Характеристика исследуемых полиморфизмов
Table 1. Characteristics of studied polymorphisms

SNP

Ген

 

Gene

Хромосома

 

Chromosome

Позиция

 

Position

Изменениепароснов

 

Base pair changes

1

rs4607517

GCK-YKT6

7

Intergenic

G>A

2

rs7566605

INSIG2

2

Intron

G>C

В основе анализа лежит метод полимеразной цепной реакции с использованием конкурирующих TaqMan-зондов, комплементарных полиморфным участкам ДНК. Амплификация проводилась с использованием пары праймеров и двух зондов, несущих «гаситель» на 3’-конце и разные флуоресцентные красители (FAM либо VIC) на 5’-конце.

 

Статистическая обработка данных

Статистический анализ был проведен с использованием программы SPSS v.16.0 иArlequin 3.1 [10].Анализ на соответствия равновесию Харди-Вайнберга проводился с использованием методов хи-квадрат. Оценку достоверности различий по показателям между группами проводили по критерию χ2 и с помощью t-теста Стьюдента. Для количественных данных тест Уилкоксона был использован для сравнения двух групп, и тест Крускала-Уаллиса для сравнения трех групп. Статистически значимыми считали различия при p<0,05.

Для выявления ассоциации полиморфных локусов в различных моделях с учетом количественных и бинарных признаков (пол, возраст), вводимых в уравнение регрессии в качестве независимых переменных, применялись метод логистической регрессии и регрессионный анализ. Для выявления генетических ассоциаций анализ проводили по следующим базовым генетическим моделям: аддитивная, доминантная и рециссивная.

 

РЕЗУЛЬТАТЫ

Основные клинические и биохимические характеристики 662 участников исследования приведены в таблице 2.

 

Таблица 2. Клинические и биохимические характеристики исследуемых групп
Table 2. Clinical and biochemical characteristics of studied groups

Показатели

Контрольная группа

 

Control

Группа больных СД2

 

T2D

р-значение

 

p-value

N

285

377

 

Мужчины,% (N)

 

Men

36.49% (104)

45.62% (172)

0.022

Возраст, год

 

Age, years

42.76±13.79

55.01±12.44

<10-5

Вес, кг

 

Weight, kg

69.13±14.96

79.82±15.32

<10-5

Рост, см

 

Height, cm

166.60±8.41

166.10±8.04

0.539

ИМТ, кг/м2

 

BMI, kg/m2

24.86±4.91

28.90±5.17

<10-5

САД, ммHg

 

SBP, mmHg

115±17.04

128.07±17.07

<10-5

ДАД, мм Hg

 

DBP, mmHg

76.45±9.46

81.7±9.58

<10-5

Курение(Да)

 

Smoking (Yes)

10.5%

26.93%

<10-5

Глюкоза, моль/л

 

Glucose, mol/l

5.07±1.13

10.76±4.72

<10-5

Холестерин, моль/л

 

Cholesterol, mol/l

4.36±1.21

5.11±1.35

<10-5

ТГ, моль/л

 

TG, mol/l

1.18±0.74

2.34±2.09

<10-5

ЛПНП, моль/л

 

LDL, mol/l

4.13±1.40

4.70±1.36

<10-5

ЛПВП, моль/л

 

HDL, mol/l

1.37±0.30

1.31±0.42

0.0002

HbA1c, %

5.84±3.40

7.99±184

<10-5

Инсулин, мклЕд/мл

 

Insulin, ulU/ml

-

14.85±13.30

-

C-пептид, нг/мл

 

C-peptide, ng/ml

-

4.09±2.90

-

Аланинаминотрансфераза,

(до 41) Е/л

 

Alaninaminotransferase, U/l

21.12±10.14

-

-

Аспартатаминотрансфераза,

(до 41) Е/л

 

Aspartateaminotransferase, U/l

22.49±9.73

-

-

Лактатдегидрогеназа, (132-228) Е/л

 

Lactatedehydrogenase, U/l

188.30±97.95

-

-

Мочевина, (3,3-8,3) ммоль/л

 

Urea, mmol/l

5.07±1.42

-

-

Креатинин,(80-115, 53-97) мкмоль/л

 

Creatinine, umol/l

79.00±15.10

-

-

Лейкоциты, (3,4-9,0*103) мкл

 

White blood cells, ul

6.21±1.48

-

-

Эритроциты, (3,6-5,3*106) мкл

 

Red blood cells, ul

4.62±0.41

-

-

Гемоглобин, (115-157) г/дл

 

Hemoglobin, g/dl

135.70±17.68

-

-

Гематокрит, (35-49)%

 

Hematocrit

43.65±25.18

-

-

Средний объем эритроцитов,(78-108) фл

 

Mean corpuscular volume, fl

90.95±7.42

-

-

Среднее содержание гемоглобина в эритроците, (26-34) пг

 

Meancorpuscularhemoglobin, pg

28.25±3.05

-

-

Тромбоциты, (130-350) мкл

 

Platelets, ul

273.40±53.13

-

-

Суммарное содержание эозинофилов, базофилов, моноцитов (2,5-20,0)%

 

Mixed cells

8.88±3.96

-

-

Нейтрофилы, (45,0-73,0)%

 

Neutrophils

48.93±21.40

-

-

Абсолютное содержание лимфоцитов, (0,8-3,8*103)мкл

 

Absolutelymphocytecounts, ul

2.03±0.61

-

-

Абсолютное содержание эозинофилов, базофилов, моноцитов, 0,1-1,5*103) мкл

 

Absolute mixed cells counts, ul

0.61±0.19

-

-

Абсолютное содержание нейтрофилов, (1,2-6,5*103) мкл

 

Absoluteneutrophilscounts, ul

3.82±3.51

-

-

Ширина распределиния эритроцитов по объему, стандартное отклонение,

(33,4-49,2) фл

 

Red cell distribution width, fl

47.01±3.72

-

-

Ширина распределинияэрит-в в %, (10,6-15,7)%

 

Red cell distribution width

13.68±7.27

-

-

Средний объем тромбоцитов,

(8,1-12,4) фл

 

Mean platelet volume, fl

10.03±1.18

-

-

Скорость оседания эритроцитов,

(1-15) мм в час

 

Erythrocyte sedimentation rate, mm h

11.77±8.22

-

-

Примечания:

1.Показатели нормы приведены в скобках для биохимических данных;

2.N–количествообразцов.

 

Notes:

  1. Standard indicators aregiven in parentheses for biochemical data;
  2. Numberofsamples.

 

В контрольной группе были 104 мужчин и 181 женщина (средний возраст 42.76±13.79 года, средний ИМТ 24.86±4.91 кг/м2,среднее САД 115±17.04 мм Hg, среднее ДАД 76.45±9.46 мм Hg), и в группе больных СД2 были 172 мужчины и 205 женщин (средний возраст 55.01±12.44 года, средний ИМТ 28.90±5.17 кг/м2, среднее САД 128.07±17.07 мм Hg, среднее ДАД 81.7±9.58 мм Hg). За исключениемроста, все измеренныефенотипызначительно отличалисьмеждуконтрольной группой и группой больных СД2 (p<0.05).

Исследуемые образцы были генотипированы и в последующем определены частоты встречаемости аллелей и распределение генотипов для каждого исследуемого полиморфизма.Изучаемые полиморфизмы соответствовали равновесию Харди-Вайнберга (p>0,05) (таблица 3).

 

Таблица 3.Распределение частот аллелей и генотипов
Table 3. Alleles frequencies and genotypes distribution

Полимор-физм

 

Polymor-phism

N

Соответствие равновесию Харди-Вайнберга

 

Hardy-Weinberg equilibrium

Аллель

 

Allele

na

Частота

 

Frequency

Генотип

 

Genotype

nb

Частота

 

Frequency

rs4607517

270

(контроль)

0.598

G

A

424

0.79

GG

165

0.61

116

0.21

AG

94

0.35

 

 

AA

11

0.04

357

(СД2)

0.318

G

A

597

0.84

GG

247

0.69

117

0.16

AG

103

0.29

 

 

AA

7

0.02

rs7566605

263

(контроль)

0.079

G

C

335

0.64

GG

114

0.43

191

0.36

CG

107

0.41

 

 

CC

42

0.16

353

(СД2)

0.00007 

G

C

444

0.63

GG

157

0.44

262

0.37

CG

130

0.37

 

 

CC

66

0.19

Примечания:

ачислохромосом;

bчислоаллелей.

 

Notes:

аnumber of chromosome;

bnumber of alleles.

 

Также проведен генетический анализ для определения возможных ассоциативных связей между исследуемыми полиморфизмами генов и СД2, ожирением идругими метаболическими компонентами в группе контроля. В таблице 4 приведены результаты генетического анализа, полученные с учетом и без количественных и бинарных признаков, таких как возраст и пол.

 

Таблица 4. Ассоциация исследуемых полиморфизмов с риском развития СД2 в казахской популяции
Table 4. Association of studied polymorphisms with the risk of developing T2D in Kazakh population

Полиморфизм

 

Polymorphism

Аддитивнаямодель

 

Additive model

Доминантнаямодель

 

Dominant model

Рецессивнаямодель

 

Recessive model

ОШ

 

OR

ДИ

 

CI

P-значение

 

P-value

ОШ

 

OR

ДИ

 

CI

P-значение

 

P-value

ОШ

 

OR

ДИ

 

CI

P-значение

 

P-value

rs4607517

(без корректировки)

0.71

0.52-0.94

0.019*

0.70

0.50-0.97

0.035*

0.47

0.17-1.21

0.125

rs4607517

(с корректировкой)

0.70

0.51-0.95

0.024*

0.71

0.49-1.01

0.058

0.38

0.13-1.04

0.063

rs7566605

(без корректировки)

1.03

0.83- 1.28

0.791

0.96

0.69-1.32

0.780

1.21

0.79-1.86

0.379

rs7566605

(с корректировкой)

0.96

0.76-1.21

0.729

0.87

0.61-1.24

0.447

1.08

 0.68-1.72

0.749

Примечания

1. Корректировка была сделана по возрасту и полу;

*статистически значимая ассоциация.

 

Notes:

1. Adjustment was made for age and sex;

*statisticallysignificantassociation.

 

Статистически значимая ассоциация с риском развития СД2 наблюдалась для полиморфизма rs4607517 в аддитивной и доминантной моделях, и эта ассоциация сохранилась после учета таких признаков как возраст и пол в аддитивной модели (p<0,05).Однако ассоциация полиморфизма rs7566605 с риском развития СД2 не прошла уровень статистической значимости.

Также участники исследования были разделены на двегруппы в зависимости отналичия или отсутствияожирения: у 261 участникане было диагнозаСД2и ожирения (контрольная группа, ИМТ<25кг/м2) и 191 имели ИМТ>30 кг/м2 (пациенты) (таблица 5).

Ассоциация полиморфизмов rs4607517 и rs7566605 с риском развития ожирения была выявлена только в рецессивной модели (p<0,05).

 

Таблица 5. Ассоциация исследуемых полиморфизмов с риском развития ожирения в казахской популяции
Table 5. Association of studied polymorphisms with the risk of developing obesity in Kazakh population

Полиморфизм

 

Polymorphism

Аддитивнаямодель

 

Additive model

Доминантнаямодель

 

Dominant model

Рецессивнаямодель

 

Recessive model

ОШ

 

OR

ДИ

 

CI

P-значение

 

P-value

 

ОШ

 

OR

ДИ

 

CI

P-значение

 

P-value

 

ОШ

 

OR

rs4607517

(без корректировки)

0.77

0.53-1.09

0.144

0.81

0.54-1.21

0.314

0.26

0.04-0.98

0.080

rs4607517

(с корректировкой)

0.77

0.51-1.13

0.182

0.84

0.54-1.31

0.452

0.20

0.03-0.82

0.045*

rs7566605

(без корректировки)

1.28

0.99-1.66

0.059

1.22

0.83-1.79

0.319

1.82

1.11-3.02

0.018*

rs7566605

(с корректировкой)

1.24

0.93-1.65

0.148

1.16

0.76-1.78

0.490

1.72

0.99-3.04

0.057

Примечания:

1. Корректировка была сделана по возрасту и полу;

*статистически значимая ассоциация.

 

Notes:

1. Adjustment was made for age and sex;

*statistically significant association.

 

Также проведен генетический анализ для определения возможных ассоциативных связей между исследуемыми полиморфизмами генов и метаболическими компонентами в группе контроля. В таблице 6 приведены результаты, которые прошли уровень статистической значимости. 

Как видно из таблицы 6, исследуемые полиморфизмы были ассоциированы с концентрациями различных клеток крови (эритроциты, тромбоциты), а также с гемоглобином.

 

ОБСУЖДЕНИЕ

Полученные результаты показали, что гены, ассоциированные с СД2 и ожирением вдругих этническихпопуляциях,также связаныс этимизаболеваниямивказахскойпопуляции. Наше исследование впервые продемонстрировало значимые ассоциации полиморфизмов в генах GCK-YKT6 иINSIG2c риском развития СД2 и ожирения.

Продукт гена GCKфосфорилирует глюкозу в глюкозо-6-фосфат, тогда как G6PC2 дефосфорилирует глюкозо-6-фосфат обратно в глюкозу, образуя цикл глюкозы в панкреатических бета-клетках.Важная роль GCK в метаболизме глюкозы была продемонстрирована многочисленными исследованиями, в том числе его роль в секреции инсулина и развитии диабета. Предполагается, что баланс между активностью GCK и G6PC2 имеет важное значение для определения гликолитического потока, производства АТФ и последующей секреции инсулина[11, 12].Наши результаты показали, что полиморфизм rs7566605 в гене GCK-YKT6ассоциирован с риском развития СД2, и эти данные подтвердились после корректировки по возрасту и полу. Также этот полиморфизм связан с риском развития ожирения, однако эта ассоциация была выявлена только в рецессивной модели. Результаты согласуются с исследованиями проведенных на других популяциях [13, 14]. Согласно DeMennaetal.(2014), исследуемый полиморфизм был ассоциирован с повышенным уровнем глюкозы натощак и гликированным гемоглобином [4]. Наши результаты не подтвердили эти данные, однако этот полиморфизм был связан с различными уровнями таких показателей как гемоглобин, средний объем эритроцитов, среднее содержание гемоглобина в эритроците и тромбоцитыв контрольной группе.

«Инсулин-индуцированный ген 2» (INSIG2) представляет собой белок, который опосредует регуляцию белков, связывающие регуляторный элемент стеролов, cleavage-activating protein, and 3-hydroxy- 3-methylglutaryl-coenzyme A reductase. INSIG2 играет важную роль в метаболизме холестерина, липогенезе и в гомеостазе глюкозы. Предыдущие исследования показали, что полиморфизмы в гене INSIG2 ассоциированы с ожирением и гиперхолестеролимией [6]. Полученные результаты согласуется с этими данными: генотип СС полиморфизма rs4607517 связан с риском развития ожирения в казахской популяции. Интересно, что исследуемый полиморфизм rs4607517 как и полиморфизм rs7566605 был ассоциирован с различными уровнями показателей крови: гемоглобин, эритроциты и средний объем тромбоцитов.

Необходимо отметить, что в этом исследовании существуют несколько ограничений. Во-первых, проанализировано небольшое количество образцов. Во-вторых, только ограниченное количество однонуклеотидных полиморфизмов проанализировано в нашей когорте. Так как работа была основана на ограниченном количестве образцов, результаты должны быть подтверждены в других подобных независимых исследованиях с использованием большего количества образцов.

 

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

В исследовании мы обнаружили статистически достоверные ассоциации междуполиморфизмамигеновGCK-YKT6 иINSIG2 c риском развития СД2 и ожирением. Также необходимо отметить, подход случай-контроль позволяет лишь предположить связь между генетическими полиморфизмами и различными фенотипами, однако не показывает причину воздействия.

 

Финансирование

Работа выполнялась в рамках проектов «Использование генетического тестирования для разработки антивозрастных программ» (2013-2015гг.) и «Создание и валидация диагностического набора для определения полиморфизма генов, ассоциированных с метаболическими нарушениями и пищевым поведением» в рамках реализации государственного заказа по бюджетной программе «Промышленные биотехнологии» (2014-2016 гг.).

REFERENCES

 

  1. American Diabetes Association. Standards of medical care in diabetes-2014. Diabetes Care, 2014, no. 1, pp.14-80.
    CrossRef
  2. International Diabetes Federation. IDF Diabetes Atlas, 7th edition.IDF, 2015,pp. 1-144.
  3. Pavlovskaja E., Kaganov B., Strokova T. Ozhirenie u detej i podrostkov – patogeneticheskie mehanizmy, klinicheskie projavlenija, principy lechenija [Obesity in children and adolescents - pathogenetic mechanisms, clinical manifestations, treatment guidelines]. Mezhdunarodnyj zhurnal pediatrii, akusherstva i ginekologii - International Journal of Pediatrics, Obstetrics and Gynecology,2013, no. 3(2), pp. 13.
  4. DeMenna J., Puppala S, Chittoor G. et al. Association of Common Genetic Variants with Diabetes and Metabolic Syndrome Related Traits in the Arizona Insulin Resistance Registry: A Focus on Mexican American Families in the Southwest.Hum Hered.,2014,no. 78(1), pp. 47-58.
    CrossRef
  5. Kudrjavceva E., Voronina E., Lifshic G.et al. Otsutstvie vlijanija polimorfnyh lokusov genov INSIG2, FTO, GNB3 na stepen' vyrazhennosti ozhirenija u bol'nyh metabolicheskim sindromom [No effect of polymorphic loci of genes INSIG2, FTO, GNB3 on the degree of severity of obesity in patients with metabolic syndrome]. Vestnik NGU. Serija: Biologija, klinicheskaja medicina - Vestnik NGU. Series: biology, clinical medicine, 2010, no. 8(3), pp. 32-39.
  6. Apalasamy Y., Moy F., Rampal S., Bulgiba A., Mohamed Z. Genetic associations of the INSIG2 rs7566605 polymorphism with obesity-related metabolic traits in Malaysian Malays.Genetics and Molecular Research, 2014, no. 13(3), pp. 4904-4910.
    PubMed
  7. World Health Organization: Definition, Diagnosis and Classification of Diabetes Mellitus and its Complications: Report of a WHO Consultation. Part 1: Diagnosis and Classification of Diabetes Mellitus. Geneva, World Health Org., 1999.
  8. World Health Organization: Definition and diagnosis of diabetes mellitus and intermediate hyperglycemia: report of a WHO/IDF consultation. Geneva, World Health Org., 2006.
  9. Miller S., Dykes D., Polesky H. A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells.Nucleic Acids Research,1988, no. 16(3), p. 1215.
    PMCID
  10. Excoffier L., Laval G., Schneider S. Arlequin ver. 3.0: an integrated software package.
  11. Li X., Shu Y.-H., Xiang A., Trigo E. et al. Additive effects of genetic variation in GCK and G6PC2 on insulin secretion and fasting glucose.Diabetes, 2009, no. 58, pp. 2946-2953.
    CrossRef
  12. Wang Y., Nie1 M., Li W.et al. Association of six single nucleotide polymorphisms with gestational diabetes mellitus in a chinese population.PLoS ONE, 2011, no. 6(11), p. e26953.
    CrossRef
  13. Chambers J., Zhang W., Zabaneh D. et al. Common genetic variation near melatonin receptor MTNR1B contributes to raised plasma glucose and increased risk of type 2 diabetes among Indian Asians and European Caucasians.Diabetes, 2009, no. 58, pp.2703-2708.
    CrossRef
  14. Fujita H., Hara K., Shojima N.et al. Variations with modest effects have an important role in the genetic background of type 2 diabetes and diabetes-related traits.J Hum Genet., 2012, no. 57, pp. 776-779.
    CrossRef

 

ҚАЗАҚ ПОПУЛЯЦИЯСЫНДА RS4607517 ЖӘНЕ RS7566605 ПОЛИМОРФИЗМДЕРІНІҢ 2 ТИПТІ ҚАНТ ДИАБЕТІ ЖӘНЕ СЕМІЗДІКПЕН АССОЦИАЦИЯСЫ

 

Сихаева Н.С.1,2, Джармуханов Ж.М.1, Накыш А.Т.3, Смагулова С.К.4, Шаймерденов С.А.4, Байдурин С.А.3, Жолдыбаева Е.В.1, Раманкулов Е.М.1,2
1ҚР БҒМ ҒК Ұлттық биотехнология орталығы,
Қорғалжын тасжолы, 13/5, Астана, 010000, Қазақстан
2Л.Н. Гумилев атындағы Еуразия Ұлттық Университеті,
Мұңайтпасов к., 5, Астана, 010000, Қазақстан
3Астана медициналық университеті,
Қошқарбаев к., 66, Астана, 010000, Қазақстан
4№4 қалалық емхана, Шевченко к., 4, Астана, 010000, Қазақстан
This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

 

ТҮЙІН

Қант диабеті және семіздік мультифакториалдық аурулар болып табылады. Олар 21 ғасырдың маңызды мәселелеріне айналды. Бұл аурулардың патогендік механизмдері өздеріне өзара әсер ететін генетикалық және экологиялық факторлардың әсерінен болатын бірнеше жолдар қосады. Көптеген зерттеулерге сәйкес, мультифакториальдық (полигендік)аурулардың даму қаупіне үлес қосатын көптеген локустар бар. GCK-YKT6 және INSIG2 гендеріндегі полиморфизмдер әртүрлі популяцияларда 2 типті қант диабеті және семіздікпен ассоциацияланған. Берілген жұмыстың мақсаты – қазақ популяциясында 2 типті қант диабеті және семіздік даму қаупімен GCK-YKT6 және INSIG2аллельдік полиморфизмдерімен ассоциациясын зерттеу. Зерттеуге 2 типті қант диабеті диагнозы бар пациенттер қосылды. Бақылау тобын емханалардан шақырылған дені сау адамдар құрды. 662 зерттеуге қатысушыларының үлгілері екі бірнуклеотидті полиморфизмдері бойынша генотиптелді: rs4607517 жәнеrs7566605. Генетикалық талдау нәтижелері 2 типті қант диабеті даму қаупімен (rs4607517: OR=0.70, CI=0.51-0.95, p=0.024 аддитив моделінде) және семіздік (rs4607517: OR=0.20, CI=0.03-0.82, p=0.045; rs7566605: OR=1.82, CI=1.11-3.02, p=0.018 рецессив моделінде) даму қаупімен байланысқан статистикалық маңызды ассоциацияларды көрсетті. Зерттелінген полиморфизмдер қан көрсеткіштерінің әртүрлі деңгейлерімен байланысқан: гемоглобин, эритроциттер және тромбоциттердің жалпы көлемі. Сонымен, біз қазақ популяциясында GCK-YKT6 және INSIG2гендерінің полиморфизмдері мен 2 типті қант диабеті және семіздік қаупімен статистикалық маңызды ассоциациялар анықтадық.

Негізгі сөздер: бірнуклеотидті полиморморфизм, 2 типті қант диабеті, семіздік, қазақ популяциясы.